Jardines del Rey

L'archipel a été nommé en 1513 par les conquistadors espagnols en l'honneur de leur roi, Ferdinand II d'Aragon.

Au Jacques de Sores en aurait utilisé une comme base d'opérations lors de ses attaques de Santiago de Cuba en 1554. Au XIX^e siècle, elles servirent de point d'entrée pour les navires négriers illégaux après l'abolition officielle de la traite négrière.

L'ancien hameau de Versalles, à l'extrémité sud du cayo, aurait été nommé ainsi par les Français qui l'habitaient. À cette époque, les activités économiques de l'île étaient l'extraction de fibres de sisal, le bois, le sel et la production de viande.

Ouragan Irma (2017)

L'ouragan Irma, en 2017, passe juste au sud des îles. Le 9 septembre à 0 h (minuit) il est en catégorie 5 sur le sud du cayo Cruz ; 2 heures plus tard il est au cayo Paredón Grande et toujours en catégorie 5 ; il redescend en catégorie 4 à 5 heures du matin juste après le cayo Guillermo, et passe au sud du cayo Fragoso à 8 heures du matin, toujours en catégorie 4 .
Son passage inflige des dégâts considérables : tous les hôtels sont sévèrement touchés, y compris de gros dégâts structuraux pour certains ; la route traversant la baie de Buena Vista  est elle aussi gravement endommagée en de nombreux endroits et les îles sont donc inaccessibles par route. Les aéroports (au cayo Coco et au cayo Las Brujas ), également lourdement atteints, sont fermés pour plusieurs semaines. La végétation a perdu 80% de son feuillage.
Un effort considérable est mis dans la reconstruction. Dès le 13 septembre la route est suffisamment réparée pour permettre le passage des ouvriers, des provisions et des matériaux. L'électricité, l'eau et les communications sont rétablies à tous les centres touristiques le 25 septembre. L'aéroport de Cayo Coco a reçoit son premier vol “post-Irma” le 3 novembre, tandis que l'aéroport de Las Brujas doit attendre le 20 décembre. Au 15 novembre, la plupart des hôtels sont rouverts à la clientèle ; le dernier hôtel à rouvrir est le Tryp Cayo Coco, le 30 novembre.