Houtkerque

La commune est située dans la région naturelle de l'Houtland, entre Lille et Dunkerque, et à proximité de la frontière franco-belge.

Communes limitrophes de Houtkerque

Bambecque	Oost-Cappel	Roesbrugge-Haringe  Belgique (Poperinge)
Herzeele		Watou  Belgique (Poperinge)
Winnezeele	Steenvoorde

La commune est située dans le bassin Artois-Picardie. Elle est drainée par l'Yser, la Haende Becque, la Becque St Acaire, la Becque de watou, la Becque du moulin de l'hofland et le Fort aux Chèvres^,,.

L'Yser est un cours d'eau transfrontalier franco-belge, d'une longueur de 70 Buysscheure. Il s'écoule vers la Mer du Nord, en traversant les Flandres française et belge, et s'y jette à Nieuport en Belgique, dans un estuaire très artificialisé.

L'Ey Becque, d'une longueur de 19 Saint-Sylvestre-Cappel et se jette dans l'Yser en limite d'Houtkerque et de la frontière belge, après avoir traversé cinq communes.

La Haende Becque, d'une longueur de 12 Steenvoorde et se jette dans l'Yser à Bambecque, après avoir traversé cinq communes.

Le territoire communal est couvert par le schéma d'aménagement et de gestion des eaux (SAGE) « Yser ». Ce document de planification concerne un territoire de 381 bassin versant de l'Yser en France. Le périmètre a été arrêté le 8 novembre 2005 et le SAGE proprement dit a été approuvé le 30 novembre 2016. La structure porteuse de l'élaboration et de la mise en œuvre est l'Union syndicale d'aménagement hydraulique du Nord (USAN).

La qualité des cours d'eau peut être consultée sur un site dédié géré par les agences de l'eau et l'Agence française pour la biodiversité.

En 2010, le climat de la commune est de type climat océanique altéré, selon une étude du CNRS s'appuyant sur une série de données couvrant la période 1971-2000. En 2020, Météo-France publie une typologie des climats de la France métropolitaine dans laquelle la commune est exposée à un climat océanique et est dans la région climatique Côtes de la Manche orientale, caractérisée par un faible ensoleillement (1 550 .

Pour la période 1971-2000, la température annuelle moyenne est de 10,8 amplitude thermique annuelle de 13,7 . Pour la période 1991-2020, la température moyenne annuelle observée sur la station météorologique la plus proche, située sur la commune de Steenvoorde à 8 vol d'oiseau, est de 11,2 ^,. Pour l'avenir, les paramètres climatiques de la commune estimés pour 2050 selon différents scénarios d'émission de gaz à effet de serre sont consultables sur un site dédié publié par Météo-France en novembre 2022.

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Mentionnée en 1049 sous la forme Holtkerka. Ce toponyme est issu du vieux néerlandais holt (moderne hout), bois et kerk, église. C'est-à-dire « église en bois ».

En 1231, le prévôt (équivalent de l'abbé) et le prieur de l'abbaye de Watten attestent que Gérard de Walle de Houtkerque a renoncé en faveur de l'abbaye Saint-Winoc de Bergues à ses droits sur une partie de la dîme de Houtkerque.

En 1303, Walter de Hondschoote seigneur de Houtkerque, et Jean de Haverskerque, seigneur de Hondschoote, vendent à Aycelin de Montaigut, archevêque de Narbonne pour la somme de 3000 livres, une rente de 300 livres sur le Trésor de France. En avril 1309, le roi de France Philippe, (Philippe IV le Bel), assigne à Walter ou Gautier de Hondschoote, seigneur de Houtkerque, 250 livres tournois sur 500 qu'il lui avait données, à prélever sur les salines de Carcassonne. En 1314(?), Philippe roi de France donne à Gautier de Hondschoote 1400 livres de rentes sur le trésor, à condition que si Gautier ne laisse que des filles, le roi pourra racheter cette rente moyennant 600 livres. En septembre 1318, Philippe, roi de France, (Philippe V le Long), confirme à Marie, fille de feu Gautier, seigneur de Hondschoote (de Hondschoote ou de Houtkerque? ou des deux?), et son mari Gaucher Regnaut, seigneur de Los (Loos?) le don d'une rente de 1400 livres tournois à prélever sur le trésor royal.

Houtkerque relevait avant la Révolution française de la châtellenie de Bergues. Le châtelain devait cependant partager le pouvoir avec la Cour féodale ou Peron de Bergues, propriété des souverains (comtes de Flandre puis rois de France) qui détenait une partie des droits sur Houtkerque. Il existait une seigneurie de Houtkerque. Elle dépendait de la Cour féodale. Le titulaire au  siècle était le comte de Hornes résidant à Douai.

Du point de vue religieux, la commune était située dans le diocèse de Thérouanne puis dans le diocèse d'Ypres, doyenné de Poperinge.

Pendant la Révolution française, le curé d'Houtkerque refuse de prêter le serment de fidélité à la révolution, prévu par la constitution civile du clergé. Mais il va plus loin en lisant lors de son prêche un texte de l'évêque d'Ypres, lequel se distingue par ses positions nettement opposées au pouvoir révolutionnaire. Puis il l'affiche dans son église.

.Comme de nombreux villages voisins, Houtkerque fut concernée de près en août-septembre 1793 par les combats entre la France et les ennemis coalisés contre elle : sièges de Bergues et Dunkerque par l'ennemi, bataille d'Hondschoote gagnée par la France. Pendant cette période, eurent lieu à Houtkerque stationnement de troupes ennemies d'abord puis françaises, affrontements, etc. voir Bataille de Hondschoote.