Crotenay

Crotenay est situé au pied du massif du Jura.

		Montrond
	Besain Picarreau Bonnefontaine	N	Champagnole
		O    Crotenay    E
		S
		Pont-du-Navoy

La commune de Crotenay s'inscrit dans la grande région naturelle du Jura externe, où elle s'est installée au Nord de la combe d'Ain dominée par la côte de l'Heute qui sépare le plateau de Champagnole du plateau de Lons-le-Saunier. Elle s'est implantée sur une haute terrasse de graviers correspondant à un delta (cône glaciolacustre) de bord de lac glaciaire qui bordait la combe.

Le site « est constitué d'une successions de cinq cordons morainiques illustrant autant de stades de retrait-stabilité et d'un delta glacio lacustre structuré par les eaux de fonte et les apports sédimentaires en bordure du paléolac de la Combe d’Ain ».

• Carte géologique simplifiée des unités structurales du massif du Jura.
• La Combe d'Ain.

En 2010, le climat de la commune est de type climat de montagne, selon une étude du Centre national de la recherche scientifique s'appuyant sur une série de données couvrant la période 1971-2000. En 2020, Météo-France publie une typologie des climats de la France métropolitaine dans laquelle la commune est exposée à un climat semi-continental et est dans la région climatique Jura, caractérisée par une forte pluviométrie en toutes saisons (1 000 à 1 500 .

Pour la période 1971-2000, la température annuelle moyenne est de 9,3 amplitude thermique annuelle de 16,9 . Pour la période 1991-2020, la température moyenne annuelle observée sur la station météorologique de Météo-France la plus proche, « Besain », sur la commune de Besain à 4 vol d'oiseau, est de 9,6 °C et le cumul annuel moyen de précipitations est de 1 525,6 mm. La température maximale relevée sur cette station est de 39,5 ^,,.

Les paramètres climatiques de la commune ont été estimés pour le milieu du siècle (2041-2070) selon différents scénarios d'émission de gaz à effet de serre à partir des nouvelles projections climatiques de référence DRIAS-2020. Ils sont consultables sur un site dédié publié par Météo-France en novembre 2022.

Erreur de référence : Des balises <ref> existent pour un groupe nommé « Note », mais aucune balise <references group="Note"/> correspondante n’a été trouvée

Situé en territoire séquane, le village s'est développé autour d'une voie romaine allant des Salins vers l'Est par les cols de Morbier et de Saint Cergue. Situé au bas de la montagne de l'Heute au milieu d'une immense plaine où serpente l'Ain, mais suffisamment large et étendue pour y accueillir un aérodrome, le village est entouré, au sortir de la montagne de l'Heute à l'Ouest par le plateau de Chatelneuf au Sud-Est, par la petite colline de Montsogeon à l'Est, par la colline plus haute du Mont-Rivel au Nord Est. L'Ain serpente dans la plaine de Crotenay venant d'un site très touristique dénommé « Perte de l'Ain » et après avoir parcouru un défilé très étroit en aval de Champagnole. Les traces d'une route protohistorique sont visibles au travers de la montagne de l'Heute, prouvant le passage très ancien de voyageurs et de charrois transportant notamment le sel des salines de Lons le Saulnier, Poligny et Salins vers le territoire des Helvètes et le lac Léman, par les cols de Morbier et de Saint Cergue.

Dans un opuscule de 1847, Édouard Clerc rapporte sans y accorder créance, qu'une tradition, accréditée dans le Jura, situe le combat de cavalerie préliminaire au siège d'Alésia dans la plaine de Crotenay, la Combe d'Ain. André Berthier reprend ce lieu dans les années 1960 dans le cadre de son hypothèse de localisation d'Alésia à Chaux-des-Crotenay.

La présence germanique y est attestée par le cimetière mérovingien de Crotenay, l’une des plus vastes nécropoles de Franche-Comté, fouillé de 1967 à 1973 ; il comprend des tombes du . Le château de Crotenay fut démantelé par Louis XI et Louis XIV.

Crotenay est chef-lieu de canton de 1790 à 1801.